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两个太阳穴疼痛的原因如下：

1.原发性头痛：如偏头痛、紧张性头痛等，都是没有特定器质性病变的疼痛，其特点是病史长且断断续续。发作一次持续数天，有的人第二天睡觉就能自愈，属于良性特发性头痛；

2、继发性头痛：可继发于全身性疾病，也可继发于颅骨内外器质性疾病，两侧太阳穴有头痛，如发热、高血压、各种代谢性中毒性脑病、颞动脉炎、脑穿通伤、硬膜下血肿、颅内器质性病变、

例如脑炎、脑膜炎、蛛网膜下腔出血、静脉窦血栓形成、肿瘤等。都会引起头痛。

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